Avec les filtres à rétrolavage, le nettoyage de l'élément filtrante se fait en ouvrant une vanne de rinçage. Une partie de l'eau filtrée est alors redirigée et passe à travers l'élément filtrant dans le sens inverse. Les particules de saleté sont ainsi détachées et évacuées par le flux. Selon le modèle, le rétrolavage peut être enclenché automatiquement ou manuellement. Il doit être effectué tous les deux mois.
Tous les filtres à rétrolavage de BWT, comme le BWT R1, fonctionnent avec un rétrolavage en 2 phases: lors de la première phase, les grosses particules sont éliminées, lors de la deuxième phase, les particules fines sur l'élément filtrant sont aspirées.